波茨坦大學(xué)主體由三個(gè)綜合校區(qū)組成（綜合校區(qū)I-III），此外還有許多單棟建筑，也屬于大學(xué)。
綜合校區(qū)
新宮綜合校區(qū)I：是大學(xué)的核心校區(qū)，毗鄰波茨坦無憂宮公園。學(xué)校最大的階梯教室（Audimax）即位于此校區(qū)。新宮的標(biāo)志建筑“陪宮（法語：communs）”，如今是哲學(xué)學(xué)院下的幾個(gè)學(xué)院所在地。這是一座18世紀(jì)巴洛克式的建筑，擁有室外階梯、石柱回廊、圓形穹頂和富麗堂皇的裝飾，原先為新宮接待賓客和提供食宿之處，如今是校長和管理機(jī)構(gòu)所在地。此外，體育學(xué)系、體育醫(yī)學(xué)系以及數(shù)學(xué)系，也在新宮校區(qū)。
戈?duì)柲肪C合校區(qū)II：數(shù)學(xué)和自然科學(xué)學(xué)院以及人類學(xué)學(xué)院的大多數(shù)專業(yè)都位于此校區(qū)。他們擁有非常現(xiàn)代和充滿新意的建筑，是柏林-勃蘭登堡州地區(qū)最大的科學(xué)園區(qū)之一。三家馬克斯·普朗克學(xué)會的研究所和兩家弗勞恩霍夫協(xié)會的研究所也位于此校區(qū)。企業(yè)孵化器“GO:IN”也在這里。
格里布尼茨湖（德語：Griebnitzsee）巴貝斯堡綜合校區(qū)III：緊鄰柏林波茨坦交界處，靠近歷史悠久的巴貝斯堡影視基地。法學(xué)院、經(jīng)濟(jì)學(xué)院、社會科學(xué)學(xué)院都在這個(gè)校區(qū)。附近的私立掛靠研究所（德語：An-Institut）——哈斯歐·普拉特納軟件研究所（德語：Hasso-Plattner-Institut），HPI），和學(xué)院有密切合作。
