芝加哥大學(xué)的學(xué)術(shù)單位主要包括本科學(xué)院部（Undergraduate College）、4所研究生院（Graduate Schools）、6所職業(yè)學(xué)院（Professional Schools）、繼續(xù)教育學(xué)院（Continuing Education School）和附屬學(xué)校等。
1）本科學(xué)院部
芝加哥大學(xué)本科學(xué)院（Undergraduate College）提供50個主修專業(yè)和28個輔修專業(yè)的理學(xué)學(xué)士和文學(xué)學(xué)士。學(xué)制四年，大致分為自然科學(xué)、生命科學(xué)、人文科學(xué)、社會科學(xué)和交叉學(xué)科五個方向。
2）研究生院
研究生院（Graduate Schools）分為四個學(xué)部，2014年秋季學(xué)期共有3468名研究生（博士及碩士）：
2.1）數(shù)理學(xué)部 （Physical Sciences Division），1024名研究生（2014年秋）
天文與天體物理系
化學(xué)系
計算機科學(xué)系
地球物理系
數(shù)學(xué)系
物理系
統(tǒng)計系
生物物理動力學(xué)研究所
計算研究所
恩里科·費米研究所（Enrico Fermi Institute, 高能物理與天體物理）
詹姆斯·弗蘭克研究所（James Franck Institute, 材料科學(xué)與工程）
史蒂文諾維奇金融數(shù)學(xué)中心
2.2）生物學(xué)部 （Biological Sciences Division），461名研究生（2014年秋）
2.3）人文學(xué)部 （Humanities Division），819名研究生（2014年秋）
弗蘭克人文科學(xué)研究所
2.4）社會科學(xué)部 （Social Sciences Division），1164名研究生（2014年秋）
人類學(xué)系
人類比較發(fā)展學(xué)系
歷史系
經(jīng)濟系
政治科學(xué)系
心理系
社會思想系
社會學(xué)系
3）職業(yè)學(xué)院
芝加哥大學(xué)擁有六所職業(yè)學(xué)院（Professional Schools）：
布斯商學(xué)院 （Booth School of Business）
法學(xué)院 （Law School）
神學(xué)院（Divinity School）
哈里斯公共政策學(xué)院（Harris School of Public Policy Studies）
普利茲克醫(yī)學(xué)院 （Pritzker School of Medicine）
社會服務(wù)管理學(xué)院（School of Social Service Administration，SSA）
3.1）法學(xué)院
芝加哥大學(xué)法學(xué)院由捐助者約翰·洛克菲勒始建于1902年，該校自成立以來一直是美國最富聲譽的法學(xué)院之一 ——2018-19年US NEWS“全美最佳法學(xué)院”排名中，芝加哥大學(xué)法學(xué)院排名第4。
芝大法學(xué)院對于社會科學(xué)在法學(xué)中的運用起到了重要的推動作用，尤其以法律經(jīng)濟學(xué)研究中心而著稱。 在法學(xué)院任教的諾貝爾經(jīng)濟學(xué)獎獲得者羅納德·科斯、美國聯(lián)邦第七巡回法院理查德·A·波斯納法官、弗蘭克H.伊斯特布魯克（Frank H. Easterbrook）法官、丹尼爾R.費舍（Daniel R. Fischel）教授等都是法律經(jīng)濟學(xué)的領(lǐng)軍人物，而法律經(jīng)濟學(xué)領(lǐng)域的奠基人、《法律經(jīng)濟學(xué)期刊》（Journal of Law and Economics）的創(chuàng)刊人亞倫·戴雷科特亦是芝加哥大學(xué)法學(xué)院教授、芝加哥經(jīng)濟學(xué)派重要人物之一。 此外，多位美國聯(lián)邦最高法院大法官、司法部長曾畢業(yè)或執(zhí)教于芝大法學(xué)院。 第44任美國總統(tǒng)貝拉克·奧巴馬從1992年到2004年也在此擔(dān)任憲法講師。
美國大學(xué)多使用4.0分制或字母分級制，在嚴(yán)峻的就業(yè)壓力下，大多數(shù)美國法學(xué)院均出現(xiàn)分?jǐn)?shù)逐漸膨脹甚至取消評分等級的趨勢芝加哥大學(xué)法學(xué)院因為長期使用一套獨有的155~186鐘形曲線評分系統(tǒng)而著稱。該系統(tǒng)的目的是嚴(yán)格控制評分，避免分?jǐn)?shù)膨脹，保證分?jǐn)?shù)的客觀價值。
3.2）布斯商學(xué)院
芝加哥大學(xué)商學(xué)院創(chuàng)建于1898年，是美國最知名的商學(xué)院之一，也是首個授予博士學(xué)位和開設(shè)EMBA課程的商學(xué)院、首個產(chǎn)生諾貝爾獎獲得者的商學(xué)院。2008年11月芝加哥大學(xué)商學(xué)院正式將學(xué)院改名為芝加哥大學(xué)布斯商學(xué)院（University of Chicago Booth School of Business），此次更名是為了紀(jì)念“有效市場假說”創(chuàng)立者尤金·法瑪（Eugene F. Fama）的弟子、芝大商學(xué)院校友大衛(wèi)·布斯（David Booth）于2008年11月6日捐贈3億美元。
芝加哥大學(xué)商學(xué)院領(lǐng)先采用學(xué)系式方法進行商業(yè)研究，其方法已經(jīng)獲得其他商學(xué)院所效仿。商學(xué)院學(xué)術(shù)獨立、教學(xué)方法強調(diào)理論基礎(chǔ)，和哈佛商學(xué)院的案例教學(xué)形成鮮明比較，各成一派。芝加哥大學(xué)商學(xué)院的擁有國際知名的教學(xué)人員，并且在多項領(lǐng)域擁有一流實力，包括金融、策略、國際商業(yè)、企業(yè)領(lǐng)導(dǎo)、整體管理、經(jīng)濟、會計、市場行銷及其創(chuàng)新的EMBA課程——此課程的校園分設(shè)于新加坡、倫敦與芝加哥，參加該課程的學(xué)員將在所有三個校園上課。
坐落在新加坡的亞洲校園創(chuàng)辦于2000年9月，位于陳旭年宅第（House of Tan Yeok Nee），這是一座經(jīng)過保留翻新的歷史建筑物，建造于1885年，擁有各種先進設(shè)施，而布斯商學(xué)院計劃從2014年起在香港開設(shè)EMBA課程。
3.3）普利茲克醫(yī)學(xué)院
芝加哥大學(xué)醫(yī)學(xué)院于1927年成立，是芝加哥大學(xué)生物科學(xué)系的醫(yī)學(xué)博士授予單位，為紀(jì)念芝加哥普利茲克家族（凱悅酒店集團的創(chuàng)始人）的慈善捐助而于1968年改名為芝加哥大學(xué)普利茲克醫(yī)學(xué)院（Pritzker School of Medicine）。1989年，著名肝膽外科學(xué)家Christoph Broelsch 在芝大醫(yī)學(xué)院成功完成了人類歷史上第一臺活體肝臟移植手術(shù)。
普利茲克醫(yī)學(xué)院在US NEWS 2018~2019年度全美最佳醫(yī)學(xué)院排行榜中位列第16名。該學(xué)院因艾滋病研究、婦女健康和初級護理方面的學(xué)術(shù)成就而著稱。醫(yī)學(xué)院20%的研究生同時輔修大學(xué)的其它專業(yè)課程，并可獲得由芝加哥大學(xué)布斯商學(xué)院、社會服務(wù)管理學(xué)院、法學(xué)院等聯(lián)合頒發(fā)的學(xué)位。普利茲克醫(yī)學(xué)院至今已有12位校友、教授以及研究人員曾獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。
3.4）哈里斯公共政策學(xué)院
哈里斯公共政策學(xué)院在US NEWS 2018~2019年度全美最佳公共政策學(xué)院中位列第3名。該學(xué)院在經(jīng)濟公共政策、衛(wèi)生公共政策以及國際關(guān)系政策中享譽盛名，教員中有兩位諾貝爾獎獲得學(xué)者與包括小布什期間財政部長和奧巴馬期間資深顧問在內(nèi)的若干美國前高級官員。
4）附屬學(xué)校
芝加哥大學(xué)實驗學(xué)校（UChicago Laboratory Schools）由曾任芝大教授的美國教育思想家、實用主義哲學(xué)家約翰·杜威于1896一手創(chuàng)辦用于美國教育實驗學(xué)校，是芝大所屬的一所全日制綜合性私立學(xué)校。學(xué)校提供從幼兒教育到小學(xué)、初中、高中12個年級的課程教育，很多美國名人均畢業(yè)于該校。此外，芝大名下還有四所公立的特許學(xué)校以及為殘疾兒童開設(shè)的海德公園日校。
